上海信帆生物：miRNA與癌癥：了解它們之間的關(guān)聯(lián)
更新時(shí)間：2016-05-16 點(diǎn)擊次數(shù)：965次在腫瘤發(fā)生的經(jīng)典模型中，癌癥通過慢慢積累突變、放任細(xì)胞增長而發(fā)生。許多這樣的突變影響關(guān)鍵的調(diào)控蛋白，如原癌基因和抑癌基因。不過，非編碼RNA基因的突變也同樣有害，尤其是microRNA。
microRNA（miRNA）是一類22個(gè)核苷酸的調(diào)控轉(zhuǎn)錄本。它們與mRNA靶點(diǎn)相結(jié)合，或抑制其翻譯，或誘導(dǎo)其降解。因此，它們也像轉(zhuǎn)錄因子一樣，影響基因表達(dá)。
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根據(jù)Brigham婦女醫(yī)院的Sean Lawler在2014年發(fā)表的綜述，*個(gè)將miRNA與癌癥相關(guān)聯(lián)的線索發(fā)表于2002年，研究發(fā)現(xiàn)慢性淋巴細(xì)胞白血病中的miR-15和miR-16缺失，導(dǎo)致它們的靶點(diǎn)BCL2上調(diào)。自那時(shí)起，人們開始研究miRNA在癌癥中的作用。
如今，研究人員已經(jīng)鑒定出數(shù)千個(gè)miRNA，并積極研究它們的生物學(xué)，以及它們是否能作為疾病、預(yù)后或治療反應(yīng)的生物標(biāo)志物。各種各樣的工具也應(yīng)運(yùn)而生，協(xié)助研究人員更好地了解miRNA的作用。
模擬物和抑制劑
大多數(shù)的miRNA工具分成兩大類：miRNA操控和miRNA表達(dá)分析。
操控這一類主要是miRNA模擬物、抑制劑和表達(dá)構(gòu)建體。模擬物和抑制劑是合成分子，顧名思義，模擬miRNA的表達(dá)或阻斷它們的調(diào)控能力。表達(dá)構(gòu)建體讓研究人員能通過一個(gè)或多個(gè)miRNA基因的轉(zhuǎn)錄，在靶細(xì)胞上施加影響。
Dharmacon（現(xiàn)屬于GE Healthcare）提供模擬物和抑制劑；這些可通過轉(zhuǎn)染導(dǎo)入細(xì)胞。據(jù)Dharmacon研發(fā)主管Melissa Kelley介紹，研究人員可以在相同條件下、不同的孔中使用模擬物和抑制劑，尋找相反的表型，以便對結(jié)果更加自信。
Dharmacon也提供慢病毒表達(dá)的模擬物，稱為shMIMIC lentiviral microRNA，用于那些無法輕易轉(zhuǎn)染或需要活性的細(xì)胞。據(jù)Kelley介紹，shMIMIC lentiviral microRNA是短的發(fā)夾結(jié)構(gòu)，在細(xì)胞中表達(dá)并被處理成成熟的miRNA，以驗(yàn)證表達(dá)特定的miRNA是否能讓細(xì)胞恢復(fù)正常生長。
表達(dá)工具
與所有RNA一樣，研究人員也可以利用新一代測序（NGS）、芯片、qPCR和原位雜交等方法來定量miRNA。
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